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近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合国内科研单位成功开发新型DNA断裂检测技术(DEtail-seq)。该技术能够在多个物种中高效地检测减数分裂DNA双链断裂位点的3’末端,是一种接近单核苷酸水平的超高分辨率全基因组DNA断裂位点检测方法。利用此技术,研究人员成功绘制了酿酒酵母、小鼠和人类的减数分裂DNA双链断裂图谱。相关研究成果发表在《中国科学—生命科学(Science China-Life Sciences)》上。
DEtail-seq实验流程示意图 中国农业科学院深圳农业基因组研究所供图
在真核生物中,减数分裂是有性繁殖所需的一个基本过程,绘制精细的减数分裂DNA双链断裂图谱,对人们了解减数分裂同源重组机制至关重要。研究团队利用单链DNA连接体系对DNA断裂3’端直接连接测序接头,再通过片段化、第二链延伸、第二接头连接等一系列步骤,完成文库构建,经测序及数据分析,获得DNA断裂3’端的位置信息。检测结果表明,新型DNA断裂检测技术分辨率极高,可达到单核苷酸或接近单核苷酸水平。研究人员利用该技术在酿酒酵母、小鼠以及人类生殖细胞中成功检测出减数分裂DNA断裂的基因组分布,并发现了减数分裂DSB的一系列新特征。
该研究得到国家自然科学基金、中国农业科学院青年创新专项等支持。